尿液代谢组学研究案例,空气中PM和生物气溶胶共同暴露的尿液代谢组学特征采用LC-MS+GC-MS双平台代谢组学方法对尿液样品进行分析,其中GC-MS检测102种代谢物,LC-MS检测到1271种。作者通过使用亚组来分析差异代谢物是否具有性别或季节性,结果表明性别和季节对本研究的结果没有明显的混杂影响。差异分析表明,Pu1和Po1之间的差异代谢物数量大于Po1和C之间的差异,LC-MS分析比GC-MS分析检测到更多的差异代谢物,体现出不同平台的检测特点。为了确定尿液中与空气污染PM暴露相关的代谢生物标志物,使用综合分析获得候选差异代谢物,其中C-Po1和Po1-Pu1比较中的重叠差异代谢物作为短期PM暴露相关标志物,确定了33种与短期暴露于空气污染相关的差异代谢物,包括8种脂质、6种核酸、7种氨基酸及其衍生物、3种葡萄糖和9种其他代谢物。KEGG通路分析表明,***富集到5种代谢通路,与免疫、炎症、人类的环境压力、缺血和缺氧有关。基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学 。浙江尿液 代谢组学
LC-MS非靶向代谢组学,中文标题:TNT、RDX、HMX(三种物)在苜蓿中的生物降解和植物毒性机制分析研究对象:苜蓿根发表期刊:Chemosphere影响因子:7.086发表时间:2021.05.18合作单位:西南科技大学运用关键技术:LC-MS非靶向代谢组学文章中LC-MS非靶向代谢组学由欧易/鹿明生物提供技术支持2021年5月,西南科技大学罗学刚教授团队在Chemosphere期刊发表的研究成果,通过LC-MS非靶向代谢组学研究方法,探索了物暴露对植物的毒性机制,验证了植物体内被降解的TNT、RDX和HMX残留物和中间产物干扰植物正常生理代谢的假设。描绘了在三种物影响下苜蓿代谢组图谱,为环境污染物毒理学研究提供了新思路和方法。上海微生物代谢组学原理代谢组学数据分析教程 代谢组学一般测几个样。
本研究通过LC-MS和GC-MS双平台代谢组学研究方法,对92例样品5个时间点的尿液样品进行分析,分别找到了33种和155种与PM和生物气溶胶相关的差异标志物,结果揭示了年轻健康人在五个不同时间点的尿液代谢谱的动态变化,采用KEGG通路富集分析和时间序列分析确定了与短期共同暴露于空气中PM和生物气溶胶相关的几种潜在代谢物生物标志物,发现短期高浓度暴露于PM可能会导致代谢改变并降低应激***水平,这可能是与下丘脑-垂体-肾上腺和交感-肾上腺-髓质轴的***有关;而生物气溶胶剂则通过***系统对病理性成瘾有重要作用。其中尿液中的16-脱氢孕酮可能是PM暴露的潜在生物标志物;4-羟基苯乙醇可能是生物气溶胶的潜在生物标志物,可用于分别预测或诊断PM或生物气溶胶相关疾病。
双平台代谢组学研究,2022年02月,中国中医科学院广安门医院李敏教授课题组在Biomedicine & Pharmacotherapy发表的题为 “Yiqi Tongluo Fang could preventive and delayed development and formation of diabetic retinopathy through antioxidant and anti-inflammatory effects ”的研究成果,发现了***通络方可有效地防治糖尿病并发症形成与发展,探究了***通络方防治糖尿病视网膜病变的作用机制,***通络方可改善糖尿病大鼠视网膜组织病理损害;提高视网膜紧密连接蛋白,保护血-视网膜屏障;抑制p38MAPK相关通路及IncRNA MALAT1水平;降低全身及局部视网膜的炎症及氧化应激水平。为***通络方防治糖尿病视网膜病变提供了实验依据。LC-MS+GC-MS双平台代谢组学主要用于***的中药成分分析。代谢组学,代谢组数据库,代谢组分析,基因检测。
代谢组学+转录组学研究:2022年2月,中国海洋大学食品科学与工程学院刘尊英教授课题组在《Foods》期刊发表的题为“Dissecting of the AI-2/LuxS Mediated Growth Characteristics and Bacteriostatic Ability of Lactiplantibacillus plantarum SS-128 by Integration of Transcriptomics and Metabolomics”的研究成果,通过转录组学和代谢组学等研究方法,发现植物乳孢杆菌可以通过AI-2/luxs介导的群体感应(QS)系统来调节其生长特性和代谢,该系统是参与食品安全的正调控因子,这将有助于研究植物乳孢杆菌的生物保护控制潜力,特别是在食品工业生物技术中的应用。代谢组学-鹿明生物-欧易生物 以生物体内所有代谢产物为研究对象。上海微生物代谢组学原理
读懂代谢组学 代谢组学的研究范畴。浙江尿液 代谢组学
GC-MS代谢组学结果:通过GC-MS代谢组学观察到 92种化合物,其中,49种与数据库中可用的化合物相匹配,包括重要的发酵代谢物,如葡萄糖、**酸、琥珀酸和几种 (n=10) 初级氨基酸。NMR也观察到了七种已鉴定的化合物。通过 GC-MS 测量,表面(15 厘米)SOM 中的糖和氨基酸浓度随温度处理而变化,随着温度的升高,通常趋向于更高的糖浓度和更低的游离氨基酸浓度(图 3)。谷氨酰胺在氨基酸中是一个明显的例外,在浓度与温度处理中观察到了积极的趋势(图 3)。此外,与植物应激反应相关的化合物(油酸、肌醇、半乳糖醇和 4-羟基-3-甲氧基苯甲酸)随温度升高而增加(SI 附录,图 S5)。浙江尿液 代谢组学
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